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  • 病毒基因组二代测序

    发布时间:2020-05-14 浏览次数:2299




    上海伯杰医疗科技有限公司构建的病毒二代测序平台,样品通过特殊处理、痕量病毒基因文库的构建、深度测序和生物信息学分析等过程,大大提高样品中病毒核酸检测灵敏度和病毒全基因组覆盖率。针对病原体含量低的临床标本我公司建立了建库前富集和捕获平台,提高病毒数据量。如近期为一客户进行的登革病毒二代测序,收集的数据中病毒序列占93.9%,其中黄病毒属全基因组的覆盖率近100%,覆盖的序列数达350000条。


    货号

    产品名称

    备注

    FW-CX-201

    病毒全基因二代测序(毒株)

    按照每株病毒收费

    FW-CX-201a

    病毒全基因二代测序(临床标本)

    按照每株病毒收费

    FW-CX-202

    细菌框架图二代测序(建库+测序)

    按照每株细菌收费

    FW-CX-202a

    细菌框架图测序A类分析

    按照每个原始数据收费

    FW-CX-202b

    细菌框架图测序B类分析

    按照每个原始数据收费

    FW-CX-203

    细菌完成图测序<7M(建库+测序)

    按照每株细菌收费

    FW-CX-203a

    细细菌完成图测序<7M(分析)

    按照每个原始数据收费

    FW-CX-204

    细菌完成图测序>7M(建库+测序)

    按照每个标本收费

    FW-CX-204a

    细菌完成图测序>7M(分析)

    按照每个原始数据收费

    FW-CX-210

    病毒宏基因组测序-DNA病毒

    按照每个标本收费

    FW-CX-211

    病毒宏基因组测序-RNA病毒

    按照每个标本收费


    病毒基因组二代测序特色介绍:

    使用的仪器设备为ThermoFisher的Ion Torrent PGM工作平台或Ilumina的 Miseq DX平台,数据分析使用本公司生信人员搭建Pipeline,拼接病毒基因组使用的是业界主流软件基础上优化过的拼接方案,以denovo拼接为主;目前已经对A型流感病毒、B型流感病毒、肠道病毒A组、呼吸道合胞病毒、副流感病毒、呼吸道腺病毒、偏肺病毒、札如入病毒、猪冠状病毒、轮状病毒A组、登革病毒、基孔肯亚病毒、日本脑炎病毒、新布尼亚病毒、诺如病毒、麻疹病毒,风疹病毒,腮腺炎丙肝病毒等进行了测序,可以联系我公司销售专员索要相关的参考报告格式。


    下面展示我公司出具测序报告的内容:

    该标本为临床原始粪便标本,肠道通用试剂盒检测阳性,标本Ct值为:28.16。

    下机数据的质量描述,包括下机数据统计和数据过滤两块内容。报告出示1个表4个图,包括数据过滤统计(Q20)、序列质量分布箱线图、碱基质量分布图、碱基分布图、GC含量分布图。




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